Les prélèvements d’échantillons sur des surfaces sont possibles grâce à la force de friction générée par l’action mécanique de frottement. À l’aide d’un outil approprié, il suffit de frotter la superficie pour y récupérer des micro-organismes. Les spécimens récoltés peuvent ensuite être détectés grâce à diverses techniques ou appareils.
La porosité de la surface de même que la superficie à analyser déterminent l’outil ou la méthode de prélèvement adéquate pour procéder à l’échantillonnage. Par exemple, les lingettes et les éponges sont recommandées pour de larges superficies (>100 cm2).
L’état de la surface à analyser peut également faire varier les résultats d’échantillonnage. Il existe plusieurs méthodes et produits pour améliorer la collecte d’échantillons et diminuer les variabilités dues à certains facteurs environnementaux. Par exemple, des agents mouillants, tels l'eau stérile ou des milieux de transport stériles, peuvent être employés pour humidifier les surfaces durant les prélèvements.
