En plus du nettoyage des surfaces où il y a eu un contact direct entre le produit et les outils pour l’échantillonnage, il est nécessaire d’allouer du temps au lavage à toutes autres parties de l’équipement où les échantillons auraient pu s’incruster. La Listeria et la Salmonelle peuvent rester longtemps sur les surfaces de travail et les ustensiles. Les tests d’échantillonnage rapides peuvent révéler la présence d’adénosine triphosphate bioluminescente comme marqueur d’insalubrité alors que les outils de microbiologie décèlent les bactéries qui auraient résisté aux agents nettoyants, comme la Listeria et la Salmonelle. Les prélèvements de surface servent aussi à évaluer les conditions microbiologiques durant la production. Pour ce faire, des échantillons sont prélevés durant la production, quelques heures après le début des activités.
Dans l’industrie de l’élevage et particulièrement en production avicole, des prélèvements de surface sont aussi prescrits.
Pour fournir des conditions d’échantillonnage aseptiques, LABPLAS propose d’ailleurs diverses trousses d’échantillonnage et plusieurs solutions neutralisantes ou non pour réaliser ces tâches.